Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms