Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1T0

Lingo1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo1Q9D1T0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lingo1Q9D1T0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lingo1Q9D1T0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lingo1Q9D1T0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lingo1Q9D1T0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lingo1Q9D1T0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lingo1Q9D1T0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lingo1Q9D1T0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lingo1Q9D1T0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lingo1Q9D1T0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lingo1Q9D1T0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lingo1Q9D1T0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lingo1Q9D1T0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lingo1Q9D1T0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lingo1Q9D1T0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lingo1Q9D1T0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lingo1Q9D1T0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lingo1Q9D1T0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lingo1Q9D1T0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lingo1Q9D1T0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lingo1Q9D1T0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lingo1Q9D1T0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lingo1Q9D1T0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lingo1Q9D1T0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lingo1Q9D1T0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lingo1Q9D1T0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lingo1Q9D1T0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lingo1Q9D1T0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lingo1Q9D1T0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms