Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D1F3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D1F3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D1F3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D1F3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D1F3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D1F3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D1F3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D1F3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D1F3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D1F3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D1F3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms