Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms