Protein–RNA interactions for Protein: Q9D132

Upk1a, Uroplakin-1a, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1aQ9D132 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Upk1aQ9D132 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Upk1aQ9D132 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Upk1aQ9D132 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk1aQ9D132 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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