Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms