Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exosc7Q9D0M0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms