Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms