Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms