Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snf8Q9CZ28 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms