Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prelid3bQ9CYY7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prelid3bQ9CYY7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prelid3bQ9CYY7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prelid3bQ9CYY7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prelid3bQ9CYY7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prelid3bQ9CYY7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prelid3bQ9CYY7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prelid3bQ9CYY7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prelid3bQ9CYY7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prelid3bQ9CYY7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prelid3bQ9CYY7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prelid3bQ9CYY7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prelid3bQ9CYY7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prelid3bQ9CYY7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prelid3bQ9CYY7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prelid3bQ9CYY7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prelid3bQ9CYY7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prelid3bQ9CYY7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prelid3bQ9CYY7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prelid3bQ9CYY7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prelid3bQ9CYY7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prelid3bQ9CYY7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms