Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl11Q9CXW4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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