Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Xrcc3Q9CXE6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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