Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Khdc3Q9CWU5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Khdc3Q9CWU5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Khdc3Q9CWU5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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