Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms