Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ddx28Q9CWT6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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