Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Cnot11Q9CWN7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Cnot11Q9CWN7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot11Q9CWN7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot11Q9CWN7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot11Q9CWN7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot11Q9CWN7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot11Q9CWN7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Cnot11Q9CWN7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot11Q9CWN7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot11Q9CWN7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot11Q9CWN7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot11Q9CWN7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot11Q9CWN7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Cnot11Q9CWN7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Cnot11Q9CWN7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot11Q9CWN7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot11Q9CWN7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot11Q9CWN7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot11Q9CWN7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot11Q9CWN7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot11Q9CWN7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot11Q9CWN7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot11Q9CWN7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot11Q9CWN7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot11Q9CWN7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot11Q9CWN7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot11Q9CWN7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot11Q9CWN7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot11Q9CWN7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot11Q9CWN7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot11Q9CWN7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot11Q9CWN7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot11Q9CWN7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot11Q9CWN7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot11Q9CWN7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot11Q9CWN7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot11Q9CWN7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot11Q9CWN7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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