Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Sycp2Q9CUU3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Sycp2Q9CUU3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Sycp2Q9CUU3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sycp2Q9CUU3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Sycp2Q9CUU3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sycp2Q9CUU3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sycp2Q9CUU3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sycp2Q9CUU3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sycp2Q9CUU3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sycp2Q9CUU3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sycp2Q9CUU3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sycp2Q9CUU3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Sycp2Q9CUU3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Sycp2Q9CUU3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Sycp2Q9CUU3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Sycp2Q9CUU3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Sycp2Q9CUU3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Sycp2Q9CUU3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Sycp2Q9CUU3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Sycp2Q9CUU3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Sycp2Q9CUU3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Sycp2Q9CUU3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Sycp2Q9CUU3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Sycp2Q9CUU3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Sycp2Q9CUU3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Sycp2Q9CUU3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Sycp2Q9CUU3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Sycp2Q9CUU3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Sycp2Q9CUU3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Sycp2Q9CUU3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Sycp2Q9CUU3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Sycp2Q9CUU3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Sycp2Q9CUU3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sycp2Q9CUU3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sycp2Q9CUU3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sycp2Q9CUU3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms