Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms