Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms