Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms