Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snw1Q9CSN1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms