Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dis3Q9CSH3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms