Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS42

Prps2, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps2Q9CS42 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prps2Q9CS42 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prps2Q9CS42 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms