Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms