Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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