Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm3Q9CQW9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm3Q9CQW9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm3Q9CQW9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm3Q9CQW9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm3Q9CQW9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm3Q9CQW9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm3Q9CQW9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm3Q9CQW9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm3Q9CQW9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm3Q9CQW9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifitm3Q9CQW9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifitm3Q9CQW9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ifitm3Q9CQW9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifitm3Q9CQW9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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Ifitm3Q9CQW9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Ifitm3Q9CQW9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Ifitm3Q9CQW9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Ifitm3Q9CQW9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Ifitm3Q9CQW9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Ifitm3Q9CQW9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ifitm3Q9CQW9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ifitm3Q9CQW9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifitm3Q9CQW9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms