Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DenrQ9CQJ6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms