Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms