Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudt21Q9CQF3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms