Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTRAFQ9CQE8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTRAFQ9CQE8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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