Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sar1bQ9CQC9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1bQ9CQC9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms