Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ubl4bQ9CQ84 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ubl4bQ9CQ84 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ubl4bQ9CQ84 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ubl4bQ9CQ84 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ubl4bQ9CQ84 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ubl4bQ9CQ84 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ubl4bQ9CQ84 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ubl4bQ9CQ84 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ubl4bQ9CQ84 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ubl4bQ9CQ84 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ubl4bQ9CQ84 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ubl4bQ9CQ84 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ubl4bQ9CQ84 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ubl4bQ9CQ84 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ubl4bQ9CQ84 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms