Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp2Q9CQ73 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms