Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms