Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms