Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ8

Cmc1, COX assembly mitochondrial protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc1Q9CPZ8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmc1Q9CPZ8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmc1Q9CPZ8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms