Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atg3Q9CPX6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg3Q9CPX6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms