Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW9

Metap1d, Methionine aminopeptidase 1D, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Metap1dQ9CPW9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Metap1dQ9CPW9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Metap1dQ9CPW9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Metap1dQ9CPW9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Metap1dQ9CPW9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Metap1dQ9CPW9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Metap1dQ9CPW9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Metap1dQ9CPW9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms