Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bhlhe41Q99PV5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms