Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrbp1Q99PL5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrbp1Q99PL5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrbp1Q99PL5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrbp1Q99PL5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrbp1Q99PL5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrbp1Q99PL5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrbp1Q99PL5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrbp1Q99PL5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrbp1Q99PL5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrbp1Q99PL5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrbp1Q99PL5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrbp1Q99PL5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rrbp1Q99PL5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rrbp1Q99PL5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rrbp1Q99PL5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rrbp1Q99PL5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rrbp1Q99PL5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rrbp1Q99PL5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rrbp1Q99PL5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rrbp1Q99PL5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rrbp1Q99PL5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rrbp1Q99PL5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rrbp1Q99PL5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrbp1Q99PL5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrbp1Q99PL5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrbp1Q99PL5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrbp1Q99PL5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrbp1Q99PL5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrbp1Q99PL5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrbp1Q99PL5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrbp1Q99PL5 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrbp1Q99PL5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrbp1Q99PL5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrbp1Q99PL5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rrbp1Q99PL5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms