Protein–RNA interactions for Protein: Q99PH1

Lrrc4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4Q99PH1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lrrc4Q99PH1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc4Q99PH1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms