Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms