Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b1Q99NB9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms