Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ubqln4Q99NB8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ubqln4Q99NB8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ubqln4Q99NB8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ubqln4Q99NB8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ubqln4Q99NB8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ubqln4Q99NB8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ubqln4Q99NB8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ubqln4Q99NB8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln4Q99NB8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms