Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcgf6Q99NA9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms