Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Usp26Q99MX1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Usp26Q99MX1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Usp26Q99MX1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Usp26Q99MX1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Usp26Q99MX1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Usp26Q99MX1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp26Q99MX1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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