Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnf17Q99MV7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rnf17Q99MV7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms