Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Tdrd1Q99MV1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tdrd1Q99MV1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Tdrd1Q99MV1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Tdrd1Q99MV1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Tdrd1Q99MV1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Tdrd1Q99MV1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Tdrd1Q99MV1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd1Q99MV1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms