Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms