Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tm2d1Q99MB3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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